Als Plankton werden im Wasser schwebende, meist mikroskopisch kleine Organismen bezeichnet. Einzellige Algen, das sogenannte Phytoplankton, stellen hier meistens den Hauptanteil der aquatischen Vegetation. Das Phytoplankton des Rheins vom Bodensee bis zum Deltagebiet wurde 2018 im Rahmen des Rheinmessprogramms Biologie untersucht. Im Langzeittrend geht die Phytoplanktonbiomasse seit den 1980er Jahren zurück und korreliert mit dem Rückgang der Nährstoffkonzentrationen und der Einträge an Phytoplankton aus dem Bodensee.