Het doel van het programma "Rijn 2040" is om de negatieve effecten van laagwater in het Rijnstroomgebied te beperken. Hiertoe zijn twee subdoelstellingen geformuleerd, die onder andere via de hieronder genoemde maatregelen moeten worden geïmplementeerd.
1. Laagwatermonitoring garanderen
2. Internationale beoordelingscriteria en oplossingsrichtingen ontwikkelen