Les éléments de qualité biologiques requis par la DCE ont été analysés de manière coordonnée pour le cours principal du Rhin sur la période 2005/2006. Le compartiment ‚Poissons’ est un indicateur des dégradations morphologiques à grande échelle, de la raréfaction du milieu alluvial, du manque de continuité, des modifications des conditions de débit (par ex. retenues d’eau, prélèvements, dérivations) et des pressions thermiques. L’éventail des espèces dans le Rhin est pratiquement complet : on relève au total 67 espèces piscicoles identifiées, y compris les 3 variétés de truites existantes et les espèces allochtones (introduites). On y retrouve à nouveau toutes les espèces jadis présentes dans l’hydrosystème, à l’exception de l’esturgeon atlantique
