La chaleur, généralement accompagnée d’un taux d’oxygène plus faible dans les eaux, peut affaiblir les animaux et les rendre plus sensibles aux agents pathogènes. Des températures élevées de l’eau peuvent par ailleurs entraîner une mortalité locale de bivalves et de poissons.
Des répercussions éventuelles supplémentaires de modifications de la température de l'eau sur les communautés aquatiques sont décrites dans le rapport CIPR n° 204.