Les grandes inondations du Rhin survenues en 1993 et en 1995 ont motivé la CIPR à adopter en 12e Conférence ministérielle sur le Rhin le 22 janvier 1998 à Rotterdam le
« Plan d'Action contre les inondations »
pour le Rhin. À l'horizon 2020, ce plan avait pour objectif de mieux protéger des inondations les personnes et leurs biens, de les préparer à y faire face tout en élargissant et en restaurant le milieu alluvial rhénan.
Quelques années après son adoption, le « Plan d'Action contre les inondations » et ses objectifs ont été incorporés dans le Programme Rhin 2020, conformément à l'approche intégrée de ce programme.
Des bilans intermédiaires ont été tirés en 2005 et 2010 :
Le bilan final, publié dans la page web Rhin 2020, affiche de nombreux résultats positifs dans la mise en œuvre des objectifs formulés en 1998. Les objectifs qui n'ont pas été complètement atteints ont été repris dans le programme Rhin 2040 ainsi que dans les Plans de gestion des risques d'inondation établis conformément à la directive communautaire 'Inondation', qui ont succédé au Plan d'Action contre les Inondations.