Aquatische Makrophyten (Wasserpflanzen) können zur Beurteilung der stofflichen Belastung von Fließgewässern herangezogen werden. Sie reagieren aber auch deutlich auf andere anthropogen bedingte Veränderungen der natürlichen Bedingungen im Fließgewässer. Insgesamt sind im Rheinstrom 36 aquatische Makrophyten nachgewiesen worden. Dabei handelt es sich um 23 höhere Pflanzen (besonders häufig Potamogeton pectinatus, Myriophyllum spicatum), 8 Moose und 5 Armleuchteralgen.
